За матеріалами організаційно-розшукового управління Департаменту Державної служби боротьби з економічною злочинністю МВС України 10 січня 2009 року Генеральною прокуратурою України порушено кримінальну справу, за ознаками складу злочину, передбаченого ч. 5 ст. 191, ч. 2 ст. 364 Кримінального кодексу України, за фактом розтрати державного майна шляхом зловживання службовим становищем та за фактом зловживання службовим становищем службовими особами НАК «Надра України».
Посадовці компанії з метою розтрати державного майна вчинили дії, направлені на виконання злочинного умислу. При збитковості компанії, усвідомлюючи відсутність потреби в 2007 році, вони придбали у ТОВ корпоративні права іншого ТОВ на суму 43 млн. грн. Як стало відомо правоохоронцям, статутний фонд цього товариства був сформований з цінних паперів фіктивних підприємств.
Внаслідок таких дій зловмисників державі було завдано збитків на зазначену суму.